火龙果内部发芽能吃。火龙果的种子在果肉的内部，并且具有一定的活性，而周围环境中含有丰富的水分，因此适宜发芽条件的时候有可能出现发芽的情况。若是火龙果的种子刚刚发芽，火龙果的品质没有任何的改变，没有出现腐烂变质、发霉的情况的话，就可以食用。遇到火龙果发芽后，只要将发芽处切除，仍能食用。
造成火龙果发芽，仍需要衡量保存时是否处理不够完善，火龙果易因为天气炎热、保存不当而造成发芽。像火龙果盛产的夏季，因天气、环境温度皆高而闷热，易增加发芽的情形。要正确保存火龙果，一般可以常温摆放于阴凉通风环境，可保存约1周，若环境或气温过高，或短时间内未食用，先避免清洗外皮，使用白报纸或塑胶袋包裹，放入冰箱冷藏区可延长存放。
